Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YIP3YNL044W 531 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 MNL2YLR057W 2550 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YCS4YLR272C 3531 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 SFT1YKL006C-A 294 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 HSH49YOR319W 642 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 USV1YPL230W 1176 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 KAP120YPL125W 3099 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 HRT3YLR097C 1035 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 ISA2YPR067W 558 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 CTF18YMR078C 2226 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YLR140WYLR140W 327 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 MGE1YOR232W 687 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 STE5YDR103W 2754 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 SDC1YDR469W 528 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 CSM2YIL132C 642 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 SPC29YPL124W 762 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YIL058WYIL058W 285 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YIL082WYIL082W 873 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 LDH1YBR204C 1128 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 DPB3YBR278W 606 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 SNX4YJL036W 1272 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 FIP1YJR093C 984 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 MAL33YBR297W 1407 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YGR149WYGR149W 1299 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 ZRG8YER033C 3231 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YDL050CYDL050C 372 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 STE24YJR117W 1362 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YDL186WYDL186W 834 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YLR053CYLR053C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 snR11snR11 258 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-GR3Q12316 YEL075CYEL075C 369 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YGR290WYGR290W 444 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 SHE3YBR130C 1278 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 PDS5YMR076C 3834 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 DXO1YDR370C 1329 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 VMA5YKL080W 1179 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 GPN3YLR243W 819 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YAR075WYAR075W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YBL028CYBL028C 321 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 MSA2YKR077W 1092 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 MED11YMR112C 396 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 NCL1YBL024W 2055 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 HTA1YDR225W 399 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 PCL6YER059W 1263 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YGL242CYGL242C 546 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 GCD2YGR083C 1956 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 COS7YDL248W 1152 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 OMA1YKR087C 1038 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 UBX4YMR067C 1251 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 MLH3YPL164C 2148 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YUH1YJR099W 711 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 RSM26YJR101W 801 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 TRM2YKR056W 1920 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 STB4YMR019W 2850 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YEL028WYEL028W 462 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 RRT15YLR162W-A 189 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 NOP15YNL110C 663 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 CAF20YOR276W 486 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YOR314WYOR314W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 ALY2YJL084C 3141 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 HAP4YKL109W 1665 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 PCL9YDL179W 915 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 FSH1YHR049W 732 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 YJL211CYJL211C 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 SUI2YJR007W 915 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 RGM1YMR182C 636 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-GR3Q12316 LST4YKL176C 2487 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YDL062WYDL062W 426 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 RSA3YLR221C 663 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 BNA7YDR428C 786 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 MMF1YIL051C 438 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 HUL5YGL141W 2733 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 MSS4YDR208W 2340 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 IFH1YLR223C 3258 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 GTR2YGR163W 1026 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YMR144WYMR144W 1029 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YPL035CYPL035C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 PIN3YPR154W 648 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 RPL31AYDL075W 342 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YDR355CYDR355C 303 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 RPA12YJR063W 378 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YBL029WYBL029W 1131 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 MRP2YPR166C 348 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 TRM12YML005W 1389 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 BEM3YPL115C 3387 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 SWI6YLR182W 2412 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 NUP145YGL092W 3954 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 DAL5YJR152W 1632 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 UBC13YDR092W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
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