Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CPSF1Q10570 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF1Q10570 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms