Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms