Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms