Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD300CQ08708 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD300CQ08708 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms