Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC3A1Q07837 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms