Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL16A1Q07092 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL16A1Q07092 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms