Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRB3Q04118 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms