Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms