Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD83Q01151 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD83Q01151 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD83Q01151 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms