Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITPNAQ00169 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms