Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNA1P78396 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms