Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms