Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2BP67870 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2BP67870 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms