Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P62684 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms