Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TMEM258P61165 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms