Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2NP61088 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2NP61088 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms