Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC01547P58512 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms