Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF3P57682 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF3P57682 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF3P57682 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF3P57682 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF3P57682 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms