Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME5P56597 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME5P56597 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NME5P56597 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NME5P56597 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NME5P56597 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME5P56597 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms