Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATP1B3P54709 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1B3P54709 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1B3P54709 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATP1B3P54709 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATP1B3P54709 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms