Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 COX8YLR395C 237 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SIP18YMR175W 240 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 RRT16YNL105W 429 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 ARL3YPL051W 597 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 GIP3YPL137C 3831 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 FKS1YLR342W 5631 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 CTF13YMR094W 1437 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YMR045CYMR045C 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SSP1YHR184W 1716 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 INP53YOR109W 3324 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YEL043WYEL043W 2871 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 snR5snR5 204 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 BRP1YGL007W 378 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 UTP30YKR060W 825 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SGT1YOR057W 1188 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 BFR1YOR198C 1413 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YJL070CYJL070C 2667 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 NPR3YHL023C 3441 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 ACB1YGR037C 264 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 VPS63YLR261C 327 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YMR254CYMR254C 309 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YPR147CYPR147C 915 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 MUD1YBR119W 897 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YPR089WYPR089W 2667 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF2P53277 USO1YDL058W 5373 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 MFB1YDR219C 1398 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 TRZ1YKR079C 2517 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SET2YJL168C 2202 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 UBR2YLR024C 5619 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 snR59snR59 78 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YDL118WYDL118W 381 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SDC1YDR469W 528 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 GLC7YER133W 939 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 PRP21YJL203W 843 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 ACF4YJR083C 930 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 SRP21YKL122C 504 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YLR224WYLR224W 1110 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 RPS22BYLR367W 393 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 CCW14YLR390W-A 717 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 RPS17AYML024W 411 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 RSA1YPL193W 1146 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YCL020WYCL020W 1317 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF2P53277 MSL5YLR116W 1431 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 ADK1YDR226W 669 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 NCB2YDR397C 441 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 TMA20YER007C-A 546 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 TDA2YER071C 381 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YJL086CYJL086C 369 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YJR087WYJR087W 351 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 ECM9YKR004C 1134 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YNL303WYNL303W 348 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YNR025CYNR025C 360 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YOL029CYOL029C 606 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 snR189snR189 189 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 KAP123YER110C 3342 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 STD1YOR047C 1335 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 VPS16YPL045W 2397 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF2P53277 UBR1YGR184C 5853 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YIL166CYIL166C 1629 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 INO80YGL150C 4470 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 KOG1YHR186C 4674 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 snR9snR9 187 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 DAD1YDR016C 285 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 UBC5YDR059C 447 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 FAR7YFR008W 666 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 EMP24YGL200C 612 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YGR226CYGR226C 210 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 GIM3YNL153C 390 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 IGO1YNL157W 507 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YNR021WYNR021W 1215 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 PEP12YOR036W 867 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YOR169CYOR169C 465 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF2P53277 YDR018CYDR018C 1191 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YGR242WYGR242W 309 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 FYV4YHR059W 393 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YIL082WYIL082W 873 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 SDL1YIL167W 633 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 PDP3YLR455W 915 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YPR153WYPR153W 423 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF2P53277 PRP6YBR055C 2700 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 DAD4YDR320C-A 219 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 GPI19YDR437W 423 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YHR054CYHR054C 1065 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 YBL012CYBL012C 402 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 SHE4YOR035C 2370 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 CBF2YGR140W 2871 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 SEC31YDL195W 3822 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF2P53277 UBP16YPL072W 1500 nt1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.4 ms