Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF138P52744 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF138P52744 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms