Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCR4P51679 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCR4P51679 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCR4P51679 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCR4P51679 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCR4P51679 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCR4P51679 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCR4P51679 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms