Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRE11P49959 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRE11P49959 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRE11P49959 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRE11P49959 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms