Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRCC3P46736 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRCC3P46736 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms