Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms