Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YPR089WYPR089W 2667 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 PRP6YBR055C 2700 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 CTF13YMR094W 1437 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YOR093CYOR093C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 USO1YDL058W 5373 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 VPS16YPL045W 2397 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YDR537CYDR537C 606 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YLR217WYLR217W 324 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 CDC37YDR168W 1521 nt2.07□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 LOC1YFR001W 615 nt2.06□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 PRP38YGR075C 729 nt2.06□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.06□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 SUS1YBR111W-A 291 nt2.06□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 UBR1YGR184C 5853 nt2.06□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YCR108CYCR108C 192 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 FYV4YHR059W 393 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 VPS63YLR261C 327 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 MIX23YBL107C 591 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 SFM1YOR021C 642 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 SME1YOR159C 285 nt2.05□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 RSM28YDR494W 1086 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 GAL80YML051W 1308 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 IPP1YBR011C 864 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 KAR9YPL269W 1935 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 SLM4YBR077C 489 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 VID24YBR105C 1089 nt2.04□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 RPS26BYER131W 360 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 LIN1YHR156C 1023 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YNL319WYNL319W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 YBR197CYBR197C 654 nt2.03□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 GIP3YPL137C 3831 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 GPI8YDR331W 1236 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YGR115CYGR115C 780 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YGR226CYGR226C 210 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 VTI1YMR197C 654 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 UBR2YLR024C 5619 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YJL070CYJL070C 2667 nt2.02□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 PES4YFR023W 1836 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 VPS38YLR360W 1320 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 COX3Q0275 810 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 SEC28YIL076W 891 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 TRM7YBR061C 933 nt2.01□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 MYO2YOR326W 4725 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 RTT101YJL047C 2529 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 GCN2YDR283C 4980 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 SNF12YNR023W 1701 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YJL016WYJL016W 1686 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 LEU3YLR451W 2661 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 PSO2YMR137C 1986 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YCR099CYCR099C 468 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 RPC25YKL144C 639 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YBR277CYBR277C 402 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YBR287WYBR287W 1284 nt2□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.99□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 DNF3YMR162C 4971 nt1.99□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.99□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YET1YKL065C 621 nt1.99□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YPT6YLR262C 648 nt1.99□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 MPH1YIR002C 2982 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YGR242WYGR242W 309 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 BRX1YOL077C 876 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YOL150CYOL150C 312 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 ADF1YCL058W-A 342 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 IPT1YDR072C 1584 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 TUS1YLR425W 3924 nt1.98□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 RTP1YMR185W 2946 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 DAD1YDR016C 285 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 YJL086CYJL086C 369 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 CAP1YKL007W 807 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 GRX5YPL059W 453 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 ARR2YPR200C 393 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 VPH1YOR270C 2523 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 DIS3YOL021C 3006 nt1.97□□□□□ -2.09
SHQ1P40486 VPS8YAL002W 3825 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 KIP1YBL063W 3336 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 YNL034WYNL034W 1839 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 NCS2YNL119W 1482 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 TAD1YGL243W 1203 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 YMR144WYMR144W 1029 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 YNR021WYNR021W 1215 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 YOR169CYOR169C 465 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 NSL1YPL233W 651 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 RRP6YOR001W 2202 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 VPS34YLR240W 2628 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 SSF2YDR312W 1362 nt1.96□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.95□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 RUD3YOR216C 1455 nt1.95□□□□□ -2.1
SHQ1P40486 RTT107YHR154W 3213 nt1.95□□□□□ -2.1
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