Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNCAP37840 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNCAP37840 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNCAP37840 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNCAP37840 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms