Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP62P37198 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms