Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5C1P36542 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5C1P36542 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5C1P36542 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP5C1P36542 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms