Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 VHR2YER064C 1518 nt4.54□□□□□ -1.68
CSE4P36012 FAA2YER015W 2235 nt4.54□□□□□ -1.68
CSE4P36012 ECM22YLR228C 2445 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 ADK1YDR226W 669 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 YGL041CYGL041C 204 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 TIM8YJR135W-A 264 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 snR49snR49 165 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 CCT7YJL111W 1653 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 RSC1YGR056W 2787 nt4.53□□□□□ -1.68
CSE4P36012 CWC22YGR278W 1734 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 OSW7YFR039C 1533 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 PAM16YJL104W 450 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 HHF1YBR009C 312 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 HEM4YOR278W 828 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 ARP7YPR034W 1434 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TOM70YNL121C 1854 nt4.52□□□□□ -1.69
CSE4P36012 NUP133YKR082W 3474 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 SLM2YNL047C 1971 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 PRK1YIL095W 2433 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 FRQ1YDR373W 573 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TSA2YDR453C 591 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 SDH2YLL041C 801 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YOR050CYOR050C 348 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 snR42snR42 351 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 DAD3YBR233W-A 285 nt4.51□□□□□ -1.69
CSE4P36012 SRO7YPR032W 3102 nt4.5□□□□□ -1.69
CSE4P36012 RPL35AYDL191W 363 nt4.5□□□□□ -1.69
CSE4P36012 DAD4YDR320C-A 219 nt4.5□□□□□ -1.69
CSE4P36012 STE14YDR410C 720 nt4.5□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YBR137WYBR137W 540 nt4.5□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TIF4632YGL049C 2745 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TRS85YDR108W 2097 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 GSC2YGR032W 5688 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 ARK1YNL020C 1917 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 MCD1YDL003W 1701 nt4.49□□□□□ -1.69
CSE4P36012 CPA2YJR109C 3357 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 HTL1YCR020W-B 237 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 HPA3YEL066W 540 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TRZ1YKR079C 2517 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 KHA1YJL094C 2622 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YDL176WYDL176W 2127 nt4.48□□□□□ -1.69
CSE4P36012 GPI10YGL142C 1851 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YDL011CYDL011C 324 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YRB1YDR002W 606 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 ALG13YGL047W 609 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 Q0143Q0143 153 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 POG1YIL122W 1056 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 GPI14YJR013W 1212 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 YLR416CYLR416C 399 nt4.47□□□□□ -1.69
CSE4P36012 UBP5YER144C 2418 nt4.46□□□□□ -1.69
CSE4P36012 TPS2YDR074W 2691 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 BCK2YER167W 2556 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 RPL14BYHL001W 417 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 URB2YJR041C 3525 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 NAN1YPL126W 2691 nt4.46□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt4.45□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YGL074CYGL074C 327 nt4.45□□□□□ -1.7
CSE4P36012 MGR1YCL044C 1254 nt4.45□□□□□ -1.7
CSE4P36012 APE2YKL157W 2859 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 PDC2YDR081C 2778 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 APL4YPR029C 2499 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YDL062WYDL062W 426 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YFH1YDL120W 525 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 RPS13YDR064W 456 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 TMA22YJR014W 597 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 IES4YOR189W 351 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YPR053CYPR053C 456 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YGR237CYGR237C 2358 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 SGO1YOR073W 1773 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 MSR1YHR091C 1932 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 SSY1YDR160W 2559 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 HCS1YKL017C 2052 nt4.44□□□□□ -1.7
CSE4P36012 MZM1YDR493W 372 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 RPA34YJL148W 702 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 YOR170WYOR170W 306 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 TIM12YBR091C 330 nt4.43□□□□□ -1.7
CSE4P36012 SEG2YKL105C 3399 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 VPS41YDR080W 2979 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 SEA4YBL104C 3117 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 CIN1YOR349W 3045 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 CSN9YDR179C 489 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 RPO31YOR116C 4383 nt4.42□□□□□ -1.7
CSE4P36012 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.41□□□□□ -1.7
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