Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYLC1P35663 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms