Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPN7P35236 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms