Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM5P33992 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM5P33992 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM5P33992 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms