Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA9P31269 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms