Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF1P30408 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms