Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGA1P29973 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms