Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM5AP29375 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5AP29375 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms