Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMLP26374 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms