Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP1P23763 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP1P23763 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms