Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF4P23510 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF4P23510 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms