Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC3P19447 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms