Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLT1P17948 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLT1P17948 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLT1P17948 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLT1P17948 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLT1P17948 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLT1P17948 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLT1P17948 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLT1P17948 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms