Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CREB1P16220 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CREB1P16220 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CREB1P16220 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CREB1P16220 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB1P16220 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB1P16220 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB1P16220 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB1P16220 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB1P16220 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB1P16220 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB1P16220 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms