Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
GSPT1P15170 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSPT1P15170 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms