Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCG2P13521 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCG2P13521 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCG2P13521 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms