Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR2C1P13056 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2C1P13056 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms