Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VPREB1P12018 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms