Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TOP2AP11388 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms